Варіант 501.V2, відомий також як 20C/501Y.V2, родовід B.1.351 та Південноафриканський варіант COVID-19 — варіант SARS-CoV-2, вірусу, що спричиняє COVID-19. Варіант був вперше виявлений у Східно-Капської провінції Південно-Африканської Республіки та повідомлений широкому загалу Департаментом охорони здоров’я країни 18 грудня 2020 року.

Варіант + Ген Нуклеотиди Амінокислоти ORF1ab C1059T T265I G5230T K1655N C8660T H2799Y C8964T S2900L A10323G K3353R G13843T D4527Y C14408T1 P4715L C17999T T5912I Шипи C21614T L18F A21801C D80A

A22206G D215G G22299T R246I G22813T K417N

G23012A E484K A23063T N501Y A23403G1 D614G G23664T A701V ORF3a G25563T Q57H C25904T S171L E C26456T P71L N C28887T T205I Примітка: 1Представлено у родоводі B.1.

Джерело:

Дослідники та чиновники повідомили, що поширеність цього варіанту була вищою серед молодих людей, які не страждають на хронічні захворювання, і в таких випадках частіше викликає серйозні захворювання, ніж інші варіанти вірусу. Департамент охорони здоров'я Південної Африки також зазначив, що варіант може бути рушієм другої хвилі пандемії COVID-19 в країні, оскільки варіант поширюється швидше, ніж інші попередні варіанти вірусу.

Вчені відзначили, що варіант може легше приєднуватися до клітин людини через три мутації рецептор-зв'язуючого домену (RBD) у шипованому глікопротеїні вірусу: N501Y (зміна аспарагіну (N) тирозином (Y)For a list of the symbols used for the α-amino acids incorporated into protein under mRNA direction, see: в амінокислотній позиції 501), K417N та E484K. Дві з цих мутацій, E484K та N501Y, знаходяться в межах рецептор-зв'язуючого мотиву (RBM) рецептор-зв'язуючого домену (RBD).

Мутація N501Y була виявлена також у Великій Британії. Дві мутації, виявлені в 501.V2, E484K та K417N, не виявлені у Варіанті 202012/01. Крім того, 501.V2 не має мутації 69-70del, знайденої в іншому варіанті.

Виявлення Новий варіант був виявлений шляхом секвенування цілого геному. Кілька геномних послідовностей з цього варіанта були подані до бази даних послідовностей , наприклад приєднання послідовностей EPI_ISL_678597.

Міжнародне поширення 23 грудня міністр охорони здоров'я Великої Британії Метью Генкок повідомив, що двоє людей, які подорожували з Південної Африки до Великої Британії, були заражені 501.V2. 28 грудня варіант був виявлений у двох людей у Швейцарії та у одного у Фінляндії. 29 грудня варіант був виявлений у подорожувальника з Південної Африки до Японії та у одного закордонного мандрівника до Квінсленда, Австралія. 30 грудня варіант був виявлений в Замбії. 31 грудня його також виявили у Франції у пасажира, який повертався з Південної Африки.

2 січня 2021 року в Південній Кореї було виявлено перший випадок цього варіанту. Австрія повідомила про перший випадок цього варіанту, а також про чотири випадки британського варіанту 4 січня. Республіка Ботсвана також виявила перший випадок зараження 4 січня. 8 січня 2021 року Республіка Ірландія повідомила про виявлення 3 випадків зараження, пов'язаних із поїздками до Південної Африки. Того ж дня у Бразилії було зареєстровано випадок повторного зараження новим варіантом вірусу жінкою, яка перенесла COVID-19, ставши першим подібним повторним зараженням у світі. Канада повідомила про перший випадок цього варіанту в Альберті 9 січня, а Ізраїль повідомив про чотири випадки, і всі вони у людей, які подорожували до Південної Африки. Нова Зеландія повідомила про перший випадок цього варіанту 10 січня. 12 січня Німеччина повідомила про виявлення мутації у шести людей з трьох різних домогосподарств. Наступного дня Бельгія повідомила про перший виявлений випадок у людини із Західної Фландрії, яка не подорожувала за межі країни. Водночас у Тайвані 1 січня 30-річний чоловік із Есватіні отримав позитивний тест на південноафриканський варіант COVID-19.

Сумісність із вакциною 4 січня 2021 року британська газета Дейлі телеграф повідомила, що оксфордський імунолог вважає, що існує «великий знак запитання» щодо потенційної стійкості нового південноафриканського варіанту до вакцин проти COVID-19, викликаючи побоювання, що вакцини можуть не бути не настільки ефективними проти цього варіанту вірусу. Того ж дня професор вакцинології Шабір Мадхі у коментарі CBS News сказав, що новий варіант 501.V2 не зможе бути стійким до вакцини, але слід враховувати, що вакцини «можуть не мати повної ефективності». Доцентом кафедри клітинної мікробіології в Саймоном Кларком, додаткові мутації білка-шипа у варіанті 501.V2 були визначені як фактор, що викликає занепокоєння, оскільки вони «можуть зробити вірус менш сприйнятливим до імунної відповіді, викликаної вакциною». Лоуренс Янг, вірусолог з Університету Ворика, також зазначив, що множинні мутації шипа у варіанта «можуть призвести до певного відходу від імунного захисту».

7 січня 2021 року було повідомлено, що дослідники Pfizer виявили, що вакцина Pfizer і BioNTech під час тестів, що включають 20 аналізів крові, змогла забезпечити захист від однієї з мутацій варіанта 501.V2 (N501Y, спільно з варіантом B1.1.7). Проте відзначили, що потрібно провести подальше розслідування для визначення рівня захисту.

Мутація E484K Повідомляється, що зміна амінокислоти E484K, мутація рецептор-зв'язуючого домену (RBD), «пов'язана з втечею від нейтралізуючих антитіл», що може негативно вплинути на ефективність вакцин проти COVID, що залежать від білка. Мутація шипів E484K була пов'язана із випадком повторного інфікування варіантом 501.V2 SARS-CoV-2 у Бразилії, який, на думку дослідників, є першим подібним випадком реінфекції, пов'язаним з цією мутацією. Можливість зміни антигенності називалась «мутацією втечі» моноклонального антитіла з можливістю нейтралізації різновидів шипових білків SARS-CoV-2.

Статистика + Випадки за країнами (оновлено станом на 16 січня 2021) Країна Підтверджені випадки Дата Примітки 2 27 23 грудня 2020 12 січня 2021 2 28 грудня 2020 1 28 грудня 2020 1 29 грудня 2020 1 29 грудня 2020 1 30 грудня 2020 1 31 грудня 2020 1 2 січня 2021 1 4 січня 2021 1 4 січня 2021 3 8 січня 2021 1 8 січня 2021 1 8 січня 2021 11 8 січня 202115 січня 2021 44 9 січня 202113 січня 2021 1 10 січня 2021 61 1 12 січня 202114 січня 2021 15 січня 2021 1 13 січня 2021 1 13 січня 2021Світ (19 інших країн) 64

Див. також Штами SARS-CoV-2: Cluster 5, Альфа, Гамма, Дельта, Епсилон, Зета, Тета, Ета, Йота, Каппа, Лямбда, М'ю, Омікрон World Community Grid

Примітки