Тета-варіант, також відомий як лінія P.3, є одним із варіантів SARS-CoV-2, вірусу, що викликає COVI-19. Варіант був вперше ідентифікований на Філіппінах 18 лютого 2021 року, коли на Центральних Вісайських островах було виявлено дві мутації, що викликають занепокоєня. Він був виявлений в Японії 12 березня 2021 року, коли мандрівник з Філіппін прибув до міжнародного аеропорту Наріта во Токіо.
Він відрізняється від тих, які вперше були виявлені у Сполученому Королівстві, Південній Африці та Бразилії, і, як вважають, представляє подібну загрозу. Варіант більш стійкий до нейтралізуючих антитіл, у тому числі отриманих внаслідок вакцинації, як, наприклад, південноафриканський та бразильський варіанти.
Відповідно до спрощеної схеми найменування, запропонованої Всесвітньою організацією охорони здоров’я, P.3 позначено як Тета-варіант, і вважається варіантом, що викликає інтерес (VOI), але ще не варіантом, що викликає занепокоєння.
Станом на липень 2021 року Тета більше не розглядається ВООЗ як варіант, який цікавить.
Класифікація
Іменування 17 березня 2021 року Служба охорони здоров’я Англії (PHE) назвала Lineage P.3 VUI-21MAR-02.
1 червня 2021 року Всесвітня організація охорони здоров’я (ВООЗ) назвала лінію P.3 тета-варіантом.
Мутації Загалом у всіх зразках (позначених нижче) спостерігали 14 замін амінокислот, включаючи сім мутацій білка. Серед мутацій спайкового білка чотири раніше були пов’язані з лініями, що викликають занепокоєння (тобто, E484K, N501Y, D614G та P681H), тоді як три додаткові заміни спостерігалися у напрямку С-кінцевої області білка (тобто E1092K, H1101Y та V1176F). У всіх зразках також була виявлена одна амінокислотна заміна на N-кінці ORF8 (тобто K2Q). Три інші мутації були помічені в 32 з 33 зразків (позначених ), включаючи делецію трьох амінокислот у позиціях білка спайка з 141 по 143. Нарешті, у всіх випадках також було виявлено п’ять синонімічних мутацій (позначених ). +Профіль мутації Theta Variant Ген Амінокислота ORF1ab С ORF8 Н +Характерні мутації Theta Variant Ген Амінокислота ORF1a D1554G S2625F D2980N L3201P D3681E L3930F ORF1b P314L L1203F A1291V С LGV141_143del E484K N501Y G593G D614G P681H S875S E1092K H1101Y V1176F ORF8 K2Q Н R203K G204R
Історія 18 лютого 2021 року Департамент охорони здоров’я Філіппін підтвердив виявлення двох мутацій COVID-19 у Центральних Вісайських островах після того, як зразки пацієнтів були відправлені для секвенування геному. Пізніше мутації були названі E484K і N501Y, які були виявлені в 37 з 50 зразків, причому обидві мутації зустрічалися одночасно в 29 з них. Офіційних назв варіантів не було, а повна послідовність ще не була визначена.
12 березня 2021 року Японія виявила цей варіант у мандрівника з Філіппін.
13 березня 2021 року Департамент охорони здоров’я підтвердив, що мутації становлять новий варіант, який був позначений як лінія P.3. Того ж дня він також підтвердив свій перший випадок лінії P.1 в країні. Хоча лінії P.1 і P.3 походять від однієї лінії B.1.1.28, у департаменті сказали, що вплив лінії P.3 на ефективність вакцини та її передачу ще не встановлено.
17 березня 2021 року Велика Британія підтвердила свої перші два випадки, коли Public Health England (PHE) назвала це VUI-21MAR-02.
30 квітня 2021 року Малайзія виявила 8 випадків походження P.3 у Сараваку.
Статистика +Підтверджені випадки за країнами (станом на 24 січня 2022 р.) Країна ЯНГОЛІН outbreak.info Регенерон Інші джерела 455 513 516 461 17 20 17 Німеччина 11 11 11 10 10 10 13 Сполучене Королівство 9 9 9 10 7 8 8 7 7 7 4 5 5 5 3 3 4 3 3 3 3 14 14 3 – 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 1 1 1 1 1Всього 550 620 624 488
Див. також
Коронавірусна хвороба 2019 на Філіппінах Штами SARS-CoV-2: Cluster 5, Альфа, Бета, Гамма, Дельта, Епсилон, Зета, Ета, Йота, Каппа, Лямбда, М'ю, Омікрон
Примітки
Посилання Лінії PANGO: звіт про новий варіант - Звіт про глобальне поширення лінії B.1.1.7 База даних секвенування GISAID – Відстеження варіантів COVID-19