Епсилон-варіант, також відомий як CAL.20C і відноситься до двох ліній PANGO B.1.427 і B.1.429, є одним із варіантів SARS-CoV-2, вірусу, що викликає COVID-19. Вперше його виявили в Каліфорнії, США, у липні 2020 року.

Станом на липень 2021 року ВООЗ більше не розглядає епсилон як варіант, який цікавить.

Мутації Варіант має п'ять визначальних мутацій (I4205V і D1183Y в гені ORF1ab і S13I, W152C, L452R в S-гені білка шипа ),Spike Variants: Epsilon, aka B.1.427/B.1.429, and CAL.20C/S:452R covdb.stanford.edu, accessed 3 July 2021 з яких L452R (раніше також виявлений в інших неспоріднених лініях) викликав особливе занепокоєння. B.1.429, можливо, є більш переданим, ніж попередні варіанти, що циркулюють локально, але для підтвердження цього необхідне подальше дослідження. Центри з контролю та профілактики захворювань (CDC) перерахували B.1.429 і пов’язаний з ним B.1.427 як « варіанти, що викликають занепокоєння », і цитує препринт, в якому говориться, що вони демонструють збільшення на ~20% передачі вірусу, що вони мають « Значний вплив на нейтралізацію деяких, але не всіх" терапевтичних засобів, які отримали дозвіл на екстрене використання (EUA) від Управління з контролю за продуктами і медикаментами (FDA) для лікування або профілактики COVID-19, і що вони помірно зменшують нейтралізацію плазмою, зібраною люди, які раніше були інфіковані вірусом або отримали вакцину проти вірусу. У травні 2021 року Всесвітня організація охорони здоров’я (ВООЗ) дала варіанту нову назву «варіант Епсилон».Helen Branswell The name game for coronavirus variants just got a little easier 31 May 2021 www.statnews.com, accessed 28 June 2021

Історія Епсилон-варіант (CAL.20C) вперше спостерігали в липні 2020 року дослідники з Медичного центру Cedars-Sinai, Каліфорнія, в одному зі 1230-ти зразків вірусу, зібраних в окрузі Лос-Анджелес з початку епідемії COVID-19. Варіант не виявляли знову до вересня, коли він знову з’явився серед зразків у Каліфорнії, але цифри залишалися дуже низькими до листопада. У листопаді 2020 року епсилон-варіант становив 36 відсотків зразків, зібраних у медичному центрі Cedars-Sinai, а до січня 2021 року епсилон-варіант становив 50 відсотків зразків. У спільному прес-релізі Каліфорнійського університету в Сан-Франциско, Департаменту охорони здоров’я Каліфорнії та Департаменту охорони здоров’я округу Санта-Клара було оголошено, що цей варіант також був виявлений в кількох округах Північної Каліфорнії. З листопада по грудень 2020 року частота цього варіанта в секвенованих випадках з Північної Каліфорнії зросла з 3% до 25%. У препринті CAL.20C описується як належить до клади Nextstrain 20C і вносить приблизно 36% зразків, тоді як новий варіант із клади 20G становить близько 24% зразків у дослідженні, зосередженому на Південній Каліфорнії. Однак зауважте, що в США загаалом 20G клад переважає, станом на січень 2021 року. Після збільшення кількості епсилон-варіант у Каліфорнії цей варіант був виявлений з різною частотою в більшості штатів США. Невеликі цифри були виявлені в інших країнах Північної Америки, а також в Європі, Азії та Австралії. За даними GISAID, станом на липень 2021 року епсилон-варіант був виявлений у 45 країнах. Після початкового збільшення його частота швидко впала з лютого 2021 року, оскільки його випереджав більш переданий варіант альфа. У квітні епсилон-варіант залишався відносно частим у частинах північної Каліфорнії, але він практично зник з півдня штату і ніколи не міг закріпитися в інших місцях; лише 3,2% усіх випадків у Сполучених Штатах були епсилон, тоді як на той час більше двох третин були альфа. +Cases by countryCountryConfirmed cases (GISAID)as of 1 July 2021Last Reported Case50,72323 June 202147408 June 202132607 May 202110326 April 20215724 April 20213722 March 20213607 May 20213007 June 20212812 May 20212110 May 20212016 April 20212012 April 20211205 May 20211008 June 20211025 February 2021827 March 2021831 January 20217701 March 2021728 April 2021510 March 2021503 June 2021428 December 2020427 March 2021401 March 2021305 February 2021330 January 2021312 April 2021220 January 2021206 February 2021211 February 2021224 February 2021228 January 2021211 February 2021222 March 2021208 January 2021119 March 2021124 April 2021112 April 2021118 January 2021107 January 2021119 March 2021102 March 2021126 January 2021116 January 2021116 February 20211World (46 countries)Total: 51,966Total as of 1 July 2021

Див. також

Штами SARS-CoV-2: Cluster 5, Альфа, Бета, Гамма, Дельта, Зета, Тета, Ета, Йота, Каппа, Лямбда, М'ю, Омікрон

Посилання