Y-boksni protein 2 je protein koji je kod ljudi kodiran genom YBX2. YBX2 je specifičan za klicine ćelije iz porodice kičmenjačkih Y-boksnih proteina koji vežu nukleinske kiseline.
Dužina polipeptidnog lanca je 364 aminokiseline, a molekulska težina 38.518 Da..
PCR analizom s hibridima somatskih ćelija čovjeka-glodara, Tekur et al. (1999) mapirali su gen YBX2 u hromosomskoj sekvenci 17p13.1-p11.2.Gu, W., Tekur, S., Reinbold, R., Eppig, J. J., Choi, Y.-C., Zheng, J. Z., Murray, M. T., Hecht, N. B. Mammalian male and female germ cells express a germ cell-specific Y-box protein, MSY2. Biol. Reprod. 59: 1266-1274, 1998. [PubMed]: 9780336
Aminokiselinski sastav Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
1020304050 MSEVEAAAGATAVPAATVPATAAGVVAVVVPVPAGEPQKGGGAGGGGGAA SGPAAGTPSAPGSRTPGNPATAVSGTPAPPARSQADKPVLAIQVLGTVKW FNVRNGYGFINRNDTKEDVFVHQTAIKRNNPRKFLRSVGDGETVEFDVVE GEKGAEATNVTGPGGVPVKGSRYAPNRRKSRRFIPRPPSVAPPPMVAEIP SAGTGPGSKGERAEDSGQRPRRWCPPPFFYRRRFVRGPRPPNQQQPIEGT DRVEPKETAPLEGHQQQGDERVPPPRFRPRYRRPFRPRPRQQPTTEGGDG ETKPSQGPADGSRPEPQRPRNRPYFQRRRQQAPGPQQAPGPRQPAAPETS APVNSGDPTTTILE
Kloniranje i ekspresija Preglednjem biblioteka cDNK ljudskog i mišjeg testisa Ybx2, nakon ponovnog skeniranja s pet osnovnih oligonukleotida iz pozitivnih klonova, Tekur et al. (1999) klonirali su YBX2, koji su nazvali contrin. Izvedeni protein s 364 aminokiseline ima izračunatu molekulsku masu od 38,6 kD i bogat je argininom i prolinom. Dijeli 69% i 73% aminokiselinskih identiteta s DBPA (CSDA), odnosno YB1 (NSEP1) i sadrži N-terminalni domen hladnog šoka (CSD), sedam navodnih mjesta fosforilacija za kazein-kinazu II, tri potencijalna mjesta fosforilacije za protein kinazu C i dvije signala jedarne lokalizacije unutar B/A otoka. Northern blot analizom otkriven je transkript od 1,8 kb samo u ljudskim testisima. YBX2 dijeli 93%, odnosno 77% aminokiselinskih identiteta s mišjim Ybx2 i ksenopusovim Frgy2.
Gu et al. (1998) klonirali su miša Ybx2, kojeg su nazvali Msy2, i alternativno preradili izoforme, Msy2a. Izvedene izoforme mišjeg Msy2 od 360 aminokiselina i Msy2a od 282 aminokiselina imale su izračunate molekulske mase od 38, odnosno 31 kD. Northern blot analizom mišjih tkiva, otkriven je Msy2 u zametnim ćelijama miša, samo s ekspresijom koja je prvi put otkrivena u testisima miševa starih 12 dana, povećavajući se značajno za 17 dana i dostigavši maksimalni nivo u testisima miša starim 22 dana , zadržavajući se u odrasloj dobi. Western blot analiza i imunohistokemijske studije otkrile su protein Msy2 u testisima miša te u oocitima u fazi diplotena i u zrelim. SDS-PAGE su pokazali da su izoforme mišjeg Msy2 i Msy2a migrirale s molekulskom masom od 52, odnosno 48 kD. Ova razlika u migraciji u odnosu na pravu molekulsku masu karakteristika je koja se dijeli s ostalim proteinima Y-boksa.
Koristeći imunohistohemijske studije, Kohno et al. (2006) otkrili su najviše nivoe DBPC u oocitima, spermatogonijama i spermatocitima sa umerenom ekspresijom u trofoblastima i niskim nivoima u plućima, srcu, kori nadbubrežne žlijezde i skeletnim mišićima. Suprotno ograničenoj distribuciji u normalnim ćelijama, pronašli su povećani nivo DBPC u različitim ljudskim karcinomima, uključujući adenokarcinome debelog crijeva (9/10) i holangiocelularne karcinome (8/10). Svi testirani tumori zametnih ćelija, uključujući seminome testisa i disgerminome jajnika, imunohistokemijskom analizom, pokazali su visok nivo DBPC.Kohno, Y., Matsuki, Y., Tanimoto, A., Izumi, H., Uchiumi, T., Kohno, K., Shimajiri, S., Sasaguri, Y. Expression of Y-box-binding protein dbpC/contrin, a potentially new cancer/testis antigen. Brit. J. Cancer 94: 710-716, 2006. [PubMed]: 16479255.Tekur, S., Pawlak, A., Guellaen, G., Hecht, N. B. Contrin, the human homologue of a germ-cell Y-box-binding protein: cloning, expression, and chromosomal localization. J. Androl. 20: 135-144, 1999. PubMed: 10100484
Također pogledajte RNK-polimeraza II Transkripcija (biologija) Translacija (biologija)
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Geni na hromosomu 17 Kategorija:Proteomika