Protein 4 efektora Cdc42 je protein koji je kod ljudi kodiran genom CDC42EP4.
Proizvod ovog gena član je porodice CDC42 koja veže proteine. Članovi ove porodice komuniciraju sa GTPazama porodice Rho i reguliraju organizaciju aktinskog citoskeleta. Pokazalo se da ovaj protein veže i CDC42 i TC10 GTPaze na GTP-ovisan način. Kada je prekomerno eksprimiran u fibroblastima, ovaj protein može da inducira stvaranje pseudopodija, što sugerira ulogu u induciranju sklopa aktinskih filamenata i kontroli oblika ćelije.
Članovi porodice Rho gvanozin trifosfataza (GTPaze) imaju važnu ulogu u modeliranju citoskeleta. Joberty et al. (1999) identificirali su porodicu proteina, koju su nazvali Borg (prema engleskom nazivu „vezivo Rho GTPaza“), koja stupa u interakciju sa Cdc42 i TC10. Proteini iz ove porodice, poput CDC42EP4, dijele nekoliko domena, uključujući domen CRIB (Cdc42, Rac interaktivno vezanje) i domen 3 BH (Borgova homologija). Dobili su djelimičnu cDNK koja kodira BORG4.
Fluorescentnom hibridizacijom in situ, Osada et al. (2000) mapirali su mišji Borg4 na hromosomu 11E, a ljudski homolog na hromosomu 17, sekvnca q24-q25.
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 356 aminokiselina, a molekulska težina 37.980 Da..
1020304050 MPILKQLVSSSVHSKRRSRADLTAEMISAPLGDFRHTMHVGRAGDAFGDT SFLNSKAGEPDGESLDEQPSSSSSKRSLLSRKFRGSKRSQSVTRGEREQR DMLGSLRDSALFVKNAMSLPQLNEKEAAEKGTSKLPKSLSSSPVKKANDG EGGDEEAGTEEAVPRRNGAAGPHSPDPLLDEQAFGDLTDLPVVPKATYGL KHAESIMSFHIDLGPSMLGDVLSIMDKEEWDPEEGEGGYHGDEGAAGTIT QAPPYAVAAPPLARQEGKAGPDLPSLPSHALEDEGWAAAAPSPGSARSMG SHTTRDSSSLSSCTSGILEERSPAFRGPDRARAAVSRQPDKEFSFMDEEE EDEIRV
Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Osada et al. (2000) klonirali su mišji gen pune dužine i cDNK ljudskog BORG4 iz mozga, odnosno biblioteke cDNK ileumske sluznice odraslih. BORG4 dijeli visoko konzervirane domene CRIB, BH1 i BH3 i manje dobro konzervirani domen BH2. RT-PCR analiza pokazala je da se Borg4 sveprisutno eksprimira na niskim nivoima u tkivima odraslih miševa.Osada, N., Kusuda, J., Suzuki, Y., Sugano, S., Hashimoto, K. Sequence analysis, gene expression, and chromosomal assignment of mouse Borg4 gene and its human orthologue. J. Hum. Genet. 45: 374-377, 2000. [PubMed]: 11185749
Klonirali su mišje sekvence pune dužine i ljudske BORG4 cDNK iz mozga, odnosno pregledali biblioteku cDNK ileumske sluznice odraslih. RT-PCR analiza pokazala je da se Borg4 sveprisutno eksprimira na niskim nivoima u tkivima odraslih miševa.
Hirsch i dr. (2001) identificirali su cDNA pune dužine koja kodira BORG4, a koju su nazvali CEP4. Utvrdili su da poput CEP1, CEP2 (606132) i CEP3, protein CEP4 sa 356 aminokiselina sadrži konzervirani domen BH2 ili CI; veže se kroz svoju CRIB domenu sa CDC42, ali ne i sa RAC (602048); izaziva stvaranje pseudopodija; a izražava se u citoplazmi i membrani fibroblasta.Hirsch, D. S., Pirone, D. M., Burbelo, P. D. A new family of Cdc42 effector proteins, CEPs, function in fibroblast and epithelial cell shape changes. J. Biol. Chem. 276: 875-883, 2001. PubMed: 11035016
Reference
Dopunska literatura
Vanjski linkovi
Kategorija:Geni na hromosomu 17 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika