La-srodni protein 6, znan i kao aheron ili član 6 porodice La ribonukleoproteinskog domena (LARP6), je protein koji je kod ljudi kodiran genom LARP6.
Valavanis et al. (2007) utvrdili su da gen ACHN sadrži najmanje dva egzona i obuhvata približno 22,6 kb. Analizom sekvence, mapirali su gen ACHN na hromosomu 15q23.Valavanis, C., Wang, Z., Sun, D., Vaine, M., Schwartz, L. M. Acheron, a novel member of the lupus antigen family, is induced during the programmed cell death of skeletal muscles in the moth Manduca sexta. Gene 393: 101-109, 2007. PubMed: 17383118
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 491 aminokiselina, a molekulska težina 54.737 Da. 1020304050 MAQSGGEARPGPKTAVQIRVAIQEAEDVDELEDEEEGAETRGAGDPARYL SPGWGSASEEEPSRGHSGTTASGGENEREDLEQEWKPPDEELIKKLVDQI EFYFSDENLEKDAFLLKHVRRNKLGYVSVKLLTSFKKVKHLTRDWRTTAH ALKYSVVLELNEDHRKVRRTTPVPLFPNENLPSKMLLVYDLYLSPKLWAL ATPQKNGRVQEKVMEHLLKLFGTFGVISSVRILKPGRELPPDIRRISSRY SQVGTQECAIVEFEEVEAAIKAHEFMITESQGKENMKAVLIGMKPPKKKP AKDKNHDEEPTASIHLNKSLNKRVEELQYMGDESSANSSSDPESNPTSPM AGRRHAATNKLSPSGHQNLFLSPNASPCTSPWSSPLAQRKGVSRKSPLAE EGRLNCSTSPEIFRKCMDYSSDSSVTPSGSPWVRRRRQAEMGTQEKSPGT SPLLSRKMQTADGLPVGVLRLPRGPDNTRGFHGHERSRACV Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija Korištenjem protokola diferencijalnog izbora, Valavanis et al. (2007) identificirali su gen LARP6, koji je povezan s programiranom ćelijskom smrću međusegmentnih mišića moljca Manduca sexta (duhanski sokolova sovica) kada završava metamorfozu od kukuljice do odrasle jedinke. Nazvali su gen aheron (Achn), prema rijeci koja u grčkoj mitologiji vodi u carstvo mrtvih. Pregledavanjem biblioteke cDNK ljudskog hipokampusa sa sekvencom koja pokazuje visoki identitet sekvence na Manduca Achn, praćenim RT-PCR, sastavili su ljudsku ACHN cDNK pune dužine. ACHN kodira izvedeni protein od 491 aminokiseline sa tri ponavljanja N-terminalnog Lupus antigena (La), mjestom amidacije, jedarnim lokalizacijskim i eksportnim signalima, navodnim motivom prepoznavanja RNK, navodnim mjestima fosforilacija i glikozilacija i tri SP ponavljanja. Ljudski protein je 46%, a 94% sličan proteinima Manduce i miša. RT-PCR analiza miševa pokazala je najveću ekspresiju Ahna u mozgu, snažnu ekspresiju u srcu, skeletnim mišićima i sjemenicima, a nižu u timusu, slezeni i bubregu. Studije pokretljivosti na gelu pokazale su da je Achn protein posttranslacijski modificiran.
Funkcija gena Valavanis et al. (2007) citirali su neobjavljene studije koje pokazuju da je Achn ključni regulatorni protein koji kontrolira diferencijaciju u nekoliko loza, a naročito mišića. Gubitak Achn bilo u C2C12 mioblastima in vitro, bilo u embrionima zebrica, rezultirao je neuspjehom u formiranju multijedarnih miocijevi. Zaključili su da je Achn regulatorni protein koji vjerovatno posreduje u različitim razvojnim i homeostatskim procesima.
Funkcionalnom karakterizacijom kvasca, Hussain et al. (2013) pokazali su da ljudski LARP4, LARP6 i LARP7, u punoj dužini nisu supresori posredovani putem tRNK, iako su njihovi La moduli (tj. La motiv (LAM) i susjedni motiv RNK prepoznavanja (RRM)) sami imali aktivnost supresije koja je bila neovisna o stabilnoj 3-prim end-zaštiti pre-tRNK. Umjesto toga, LARP4, LARP6 i LARP7 bili su RNK šaperoni čije su aktivnosti bile neovisne od UUU-3-prim-OH vezivanja i bile su usredotočene oko RRM-a i sekvence neposredno nizvodno od RRM-a. Aktivnost supresije posredstvom tRNK posredovanih La modula povezana je s aktivnošću šaperona, budući da je LAM djelovao kao pomoćna struktura koja je pomogla regrutovanju RNK u susjedni RRM.Hussain, R. H., Zawawi, M., Bayfield, M. A. Conservation of RNA chaperone activity of the human La-related proteins 4, 6 and 7. Nucleic Acids Res. 41: 8715-8725, 2013. PubMed: 23887937
Klinički značaj U nedavnoj studiji povezanosti genoma, gen LARP6 povezan je sa osobinama glukoze natašte, diabetes mellitus tip 2 i gojaznost.
Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 15 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika