T-ćelijski leukemijski/limfomski protein 1B je protein koji je kod ljudi kodiran genom TCL1B.
PCR analizom hibridnog radijacijskog panela, Pekarsky et al. (1999) mapirali su gen TCL1B na hromosomu 14, sekvenca 14q32.1. Analiza pulsnog polja pozitivnog BAC klona otkrila je da se gen TCL1B nalazi približno 16 kb centromerno od gena TCL1A. Profili ekspresije dva gena su vrlo slični: oba su eksprimirana na vrlo niskim nivoima u normalnoj koštanoj srži i limfocitima periferne krvi, ali se aktiviraju u leukemiji T-ćelija, preuređenjem regije 14q32.1. Dakle, translokacije i inverzije na 14q32.1 u malignostima T-ćelija uključuju dva onkogena.Pekarsky, Y., Hallas, C., Isobe, M., Russo, G., Croce, C. M. Abnormalities at 14q32.1 in T cell malignancies involve two oncogenes. Proc. Nat. Acad. Sci. 96: 2949-2951, 1999. PubMed: 10077617 Hallas et al. (1999) predstavili su analizu kloniranja, mapiranja i ekspresije lokusa TCL1/Tcl1 kod ljudi i miševa. Otkrili su da osim TCL1A i TCL1B, ljudski lokus sadrži dva dodatna gena, TNG1 i TNG2, koji kodiraju proteine sa 141, odnosno 110 aminokiselina. Njihovi profili ekspresije bili su vrlo slični profilima TCL1A i TCL1B.Hallas, C., Pekarsky, Y., Itoyama, T., Varnum, J., Bichi, R., Rothstein, J. L., Croce, C. M. Genomic analysis of human and mouse TCL1 loci reveals a complex of tightly clustered genes. Proc. Nat. Acad. Sci. 96: 14418-14423, 1999. PubMed: 10588720
Aminokiselinska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 128 aminokiselina, a molekulska težina 14.846 Da..
1020304050 MASEASVRLGVPPGRLWIQRPGIYEDEEGRTWVTVVVRFNPSRREWARAS QGSRYEPSITVHLWQMAVHTRELLSSGQMPFSQLPAVWQLYPGRKYRAAD SSFWEIADHGQIDSMEQLVLTYQPERKD Simboli
C: Cistein D: Asparaginska kiselina E: Glutaminska kiselina F: Fenilalanin G: Glicin H: Histidin I: Izoleucin K: Lizin L: Leucin M: Metionin N: Asparagin P: Prolin Q: Glutamin R: Arginin S: Serin T: Treonin V: Valin W: Triptofan Y: Tirozin
Kloniranje i ekspresija TCL1A onkogen na poziciji 14q32.1 uključen je u razvoj leukemije T-ćelija. Njegova ekspresija u ovim leukemijama aktivira se hromosomskim translokacijama i inverzijama na 14q32.1. Pretražujući EST bazu podataka za sekvence homologne TCL1A i MTCP1, član porodice gena TCL1 koji se nalazi na Xq28 i aktivira se u rijetkim slučajevima zrele T-ćelijske leukemije sa (X;14) translokacijom, Pekarsky et al. (1999) izolirali su TCL1B, novog člana porodice gena TCL1. cDNK sa približno 1,2 kb TCL1B kodira 14-kD protein, koji sadrži 128 aminokiselina i pokazuje 60% sličnosti sekvence s proteinom TCL1A. Hallas et al. (1999) okarakterizirali su mišji lokus Tcl1a i pronašli pet gena homolognih ljudskom TCL1B. Pet proteina Tcl1b imali su veličine od 117 do 123 aminokiseline i bili su slični 65–80%, ali su pokazali samo 30–40% sličnosti s ljudskim TCL1B. Sve mišje Tcl1b i Tcl1a iRNK bile su prisutne u mišjim oocitima i dvoćelijskim embrionima, ali rijetko u različitim tkivima odraslih i limfoidnim ćelijskim linijama. Ovi podaci ukazuju na sličnu ili komplementarnu funkciju ovih proteina u ranoj embriogenezi. Reference
Dopunska literatura
Kategorija:Geni na hromosomu 14 Kategorija:Ljudski proteini Kategorija:Proteomika